目前常见的无籽西瓜主要是利用多倍体育种。
其步骤如下：
取正常二倍体西瓜幼苗，用秋水仙素处理，使其染色体加倍，变成四倍体；将正常植株（二倍体）的花粉受在四倍体的雌蕊上，所结的瓜的种子为三倍体；将种子种下，用二倍体的花粉授给三倍体雌蕊，这样结出的瓜就是无籽的。
原因就在于其栽培程序繁杂。
由于无籽西瓜植株发育不良，且自身没有可繁殖的花粉,因此必须事先种植用于授粉的其他品种。
其次，也有人认为没有瓜子的西瓜失去了西瓜原本的味道，消费的人群也并不多，所以一直都没得到很好的普及。
